Le parc Algonquin offre de bonnes occasions d'observer la faune,
particulièrement l'orignal. Les possibilités d'observer des orignaux, qui sont inégalables en Ontario, sont meilleures au printemps, au début de l'été et durant la période de reproduction à la fin de septembre.

Des cerfs de Virginie et des ours habitent également dans le parc. Le parc Algonquin est réputé pour ses loups que l'on entend souvent, mais que l'on voit rarement. Joignez-vous au personnel du parc lors d'excursions d'appel aux loups, qui sont tenues chaque année au mois d'août.

Plus de 260 espèces d'oiseaux ont été identifiées dans le parc. Plusieurs observateurs d'oiseaux du Sud et de l'étranger se rendent spécialement dans le parc pour voir des espèces particulières du Nord, comme le geai du Canada et le tétras des savanes. Le parc abrite aussi une riche variété de fauvettes ainsi que l'oiseau le plus célèbre du parc, le huart, qui fait son nid dans presque tous les lacs du parc.